冷庫的圍護墻體結構設計除滿足強度和穩定性外，還應保持絕熱層及隔氣層的連續性,使之符合建筑熱工要求。因為冷庫的屋面結構受太陽直接照射的時間較長,受氣溫變化的影響、會產生膨脹或收縮變形，所以采用預制構件、使變形在構件之間進行調整。從而減小總變形，為了防止因屋面伸縮對墻體產生的不利影響。可在屋面結構與墻體之間設計成滑動接觸面，由于水果冷庫主要用于食品的冷凍加工及冷藏；所以需要通過人工制冷，使室內保持一定的低溫。

水果冷庫的建筑材料和冷庫的各部分構造不僅要有足夠的抗凍性能，還能防止水蒸氣的擴散和空氣的滲透。因為室外空氣侵入時不但增加冷藏庫的耗冷量，而且還向庫房內帶入水分、水分的凝結引起建筑結構特別是隔熱結構受潮凍結損壞；所以要設置防潮隔熱層、使冷藏庫建筑具有良好的密封性和防潮隔汽性能。此外，中型水果冷庫的地基受低溫的影響，土壤中的水分易被凍結，因土壤凍結后體積膨脹、會引起地面破裂及整個建筑結構變形，嚴重的會使冷庫不能使用。為此低溫冷庫地坪除要有有效的隔熱層外，隔熱層下還必須進行處理,以防止土壤凍結。

水果冷庫建筑和設計的時候都要做到嚴格的隔熱性、密封性、堅固性和抗凍性，以此來保障冷庫的使用壽命，延長冷庫的使用年限。